Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrp2bpQ9D4C6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms