Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V5

Fsip1, Fibrous sheath-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fsip1Q9D3V5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fsip1Q9D3V5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fsip1Q9D3V5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms