Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q5

Serpinb3b, MCG21235, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb3bQ9D1Q5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Serpinb3bQ9D1Q5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Serpinb3bQ9D1Q5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms