Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.9 ms