Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tsnaxip1Q99P25 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms