Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcf2Q99LE6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms