Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf34Q99KR6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms