Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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