Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms