Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dkk4Q8VEJ3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dkk4Q8VEJ3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dkk4Q8VEJ3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dkk4Q8VEJ3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dkk4Q8VEJ3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dkk4Q8VEJ3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dkk4Q8VEJ3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dkk4Q8VEJ3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dkk4Q8VEJ3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dkk4Q8VEJ3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dkk4Q8VEJ3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dkk4Q8VEJ3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dkk4Q8VEJ3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk4Q8VEJ3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk4Q8VEJ3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk4Q8VEJ3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk4Q8VEJ3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk4Q8VEJ3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms