Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt79Q8VED5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms