Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CipcQ8R0W1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CipcQ8R0W1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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