Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3V1

Spata4, Spermatogenesis-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata4Q8K3V1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spata4Q8K3V1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spata4Q8K3V1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Spata4Q8K3V1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.4 ms