Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nsun3Q8CCT7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nsun3Q8CCT7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nsun3Q8CCT7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nsun3Q8CCT7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nsun3Q8CCT7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nsun3Q8CCT7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nsun3Q8CCT7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nsun3Q8CCT7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nsun3Q8CCT7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nsun3Q8CCT7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nsun3Q8CCT7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nsun3Q8CCT7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nsun3Q8CCT7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nsun3Q8CCT7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nsun3Q8CCT7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nsun3Q8CCT7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nsun3Q8CCT7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nsun3Q8CCT7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nsun3Q8CCT7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nsun3Q8CCT7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms