Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930507D05RikQ8C9C9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms