Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccdc30Q8BVF4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms