Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms