Protein–RNA interactions for Protein: Q8BN57

Protein C3orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BN57 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BN57 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BN57 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BN57 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BN57 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BN57 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BN57 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BN57 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BN57 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BN57 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BN57 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BN57 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BN57 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BN57 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BN57 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BN57 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BN57 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BN57 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BN57 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BN57 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BN57 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BN57 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BN57 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BN57 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BN57 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BN57 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BN57 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BN57 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BN57 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BN57 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BN57 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BN57 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BN57 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BN57 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BN57 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BN57 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BN57 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BN57 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BN57 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BN57 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BN57 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BN57 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BN57 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BN57 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BN57 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BN57 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8BN57 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8BN57 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8BN57 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BN57 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BN57 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BN57 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BN57 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BN57 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BN57 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BN57 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BN57 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BN57 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BN57 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BN57 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BN57 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BN57 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BN57 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BN57 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BN57 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BN57 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BN57 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BN57 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BN57 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BN57 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BN57 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BN57 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BN57 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BN57 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BN57 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BN57 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BN57 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BN57 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BN57 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BN57 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BN57 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BN57 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BN57 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BN57 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BN57 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BN57 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BN57 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BN57 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BN57 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BN57 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BN57 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BN57 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BN57 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BN57 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BN57 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BN57 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BN57 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BN57 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BN57 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8BN57 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms