Protein–RNA interactions for Protein: Q80V91

Dtx3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3Q80V91 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dtx3Q80V91 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dtx3Q80V91 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dtx3Q80V91 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dtx3Q80V91 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dtx3Q80V91 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dtx3Q80V91 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dtx3Q80V91 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Dtx3Q80V91 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dtx3Q80V91 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dtx3Q80V91 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dtx3Q80V91 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dtx3Q80V91 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dtx3Q80V91 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dtx3Q80V91 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dtx3Q80V91 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dtx3Q80V91 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dtx3Q80V91 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dtx3Q80V91 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dtx3Q80V91 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dtx3Q80V91 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dtx3Q80V91 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dtx3Q80V91 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dtx3Q80V91 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms