Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup214Q80U93 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms