Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc93Q7TQK5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc93Q7TQK5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc93Q7TQK5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc93Q7TQK5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc93Q7TQK5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc93Q7TQK5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc93Q7TQK5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc93Q7TQK5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc93Q7TQK5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc93Q7TQK5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc93Q7TQK5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc93Q7TQK5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc93Q7TQK5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc93Q7TQK5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc93Q7TQK5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc93Q7TQK5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc93Q7TQK5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc93Q7TQK5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc93Q7TQK5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc93Q7TQK5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc93Q7TQK5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.9 ms