Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ssxb10Q6XAR7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssxb10Q6XAR7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ssxb10Q6XAR7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Ssxb10Q6XAR7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ssxb10Q6XAR7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ssxb10Q6XAR7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ssxb10Q6XAR7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssxb10Q6XAR7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssxb10Q6XAR7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms