Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp8b3Q6UQ17 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp8b3Q6UQ17 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp8b3Q6UQ17 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp8b3Q6UQ17 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp8b3Q6UQ17 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp8b3Q6UQ17 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp8b3Q6UQ17 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp8b3Q6UQ17 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp8b3Q6UQ17 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp8b3Q6UQ17 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp8b3Q6UQ17 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp8b3Q6UQ17 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp8b3Q6UQ17 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp8b3Q6UQ17 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp8b3Q6UQ17 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp8b3Q6UQ17 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp8b3Q6UQ17 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp8b3Q6UQ17 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp8b3Q6UQ17 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp8b3Q6UQ17 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp8b3Q6UQ17 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp8b3Q6UQ17 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp8b3Q6UQ17 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp8b3Q6UQ17 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp8b3Q6UQ17 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
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