Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms