Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q6PD19 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q6PD19 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q6PD19 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q6PD19 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q6PD19 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q6PD19 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Q6PD19 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q6PD19 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q6PD19 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q6PD19 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q6PD19 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q6PD19 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q6PD19 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q6PD19 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q6PD19 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q6PD19 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q6PD19 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q6PD19 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q6PD19 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q6PD19 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q6PD19 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q6PD19 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q6PD19 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q6PD19 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q6PD19 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q6PD19 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q6PD19 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q6PD19 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q6PD19 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q6PD19 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q6PD19 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q6PD19 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q6PD19 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q6PD19 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q6PD19 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q6PD19 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q6PD19 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q6PD19 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q6PD19 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q6PD19 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q6PD19 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q6PD19 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q6PD19 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q6PD19 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q6PD19 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q6PD19 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q6PD19 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q6PD19 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q6PD19 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q6PD19 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q6PD19 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q6PD19 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q6PD19 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q6PD19 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q6PD19 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q6PD19 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q6PD19 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q6PD19 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q6PD19 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q6PD19 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q6PD19 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q6PD19 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q6PD19 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q6PD19 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q6PD19 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Q6PD19 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Q6PD19 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q6PD19 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q6PD19 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q6PD19 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q6PD19 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q6PD19 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q6PD19 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q6PD19 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q6PD19 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q6PD19 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q6PD19 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q6PD19 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q6PD19 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q6PD19 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Q6PD19 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Q6PD19 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q6PD19 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q6PD19 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q6PD19 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q6PD19 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q6PD19 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q6PD19 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q6PD19 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q6PD19 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q6PD19 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q6PD19 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q6PD19 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q6PD19 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q6PD19 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q6PD19 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q6PD19 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q6PD19 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q6PD19 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms