Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac4Q6NZM9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms