Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms