Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD9

Bfsp2, Phakinin, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bfsp2Q6NVD9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bfsp2Q6NVD9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms