Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ScapQ6GQT6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ScapQ6GQT6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ScapQ6GQT6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ScapQ6GQT6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ScapQ6GQT6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ScapQ6GQT6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ScapQ6GQT6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ScapQ6GQT6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ScapQ6GQT6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ScapQ6GQT6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ScapQ6GQT6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ScapQ6GQT6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ScapQ6GQT6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ScapQ6GQT6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ScapQ6GQT6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ScapQ6GQT6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ScapQ6GQT6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ScapQ6GQT6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ScapQ6GQT6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ScapQ6GQT6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ScapQ6GQT6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ScapQ6GQT6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ScapQ6GQT6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ScapQ6GQT6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ScapQ6GQT6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ScapQ6GQT6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms