Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atg9aQ68FE2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms