Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cln3Q61124 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 309.7 ms