Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc125Q5U465 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc125Q5U465 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms