Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trim58Q5NCC9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms