Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam228bQ497Q6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms