Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930567H17RikQ3V0K5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms