Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnaaf3Q3UYV8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms