Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BB287469Q3UT53 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms