Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms