Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctu2Q3U308 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctu2Q3U308 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctu2Q3U308 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctu2Q3U308 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctu2Q3U308 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctu2Q3U308 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctu2Q3U308 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctu2Q3U308 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctu2Q3U308 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctu2Q3U308 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctu2Q3U308 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctu2Q3U308 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctu2Q3U308 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu2Q3U308 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu2Q3U308 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu2Q3U308 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu2Q3U308 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu2Q3U308 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu2Q3U308 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu2Q3U308 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu2Q3U308 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu2Q3U308 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu2Q3U308 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctu2Q3U308 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctu2Q3U308 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctu2Q3U308 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms