Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rufy4Q3TYX8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms