Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ptchd1Q14B62 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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