Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc138Q0VF22 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms