Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MitfQ08874 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MitfQ08874 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MitfQ08874 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MitfQ08874 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MitfQ08874 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MitfQ08874 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms