Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf9Q07105 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdf9Q07105 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 267.7 ms