Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms