Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r236Q05A06 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms