Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pax5Q02650 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms