Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms