Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbp10Q000W5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms