Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
rp9P97762 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
rp9P97762 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
rp9P97762 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
rp9P97762 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
rp9P97762 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
rp9P97762 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
rp9P97762 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
rp9P97762 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
rp9P97762 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
rp9P97762 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
rp9P97762 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
rp9P97762 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
rp9P97762 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
rp9P97762 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
rp9P97762 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
rp9P97762 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
rp9P97762 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
rp9P97762 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
rp9P97762 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
rp9P97762 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
rp9P97762 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
rp9P97762 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
rp9P97762 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
rp9P97762 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
rp9P97762 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
rp9P97762 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
rp9P97762 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
rp9P97762 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
rp9P97762 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
rp9P97762 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
rp9P97762 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
rp9P97762 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
rp9P97762 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
rp9P97762 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
rp9P97762 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
rp9P97762 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
rp9P97762 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
rp9P97762 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
rp9P97762 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
rp9P97762 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
rp9P97762 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
rp9P97762 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
rp9P97762 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
rp9P97762 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
rp9P97762 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
rp9P97762 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
rp9P97762 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
rp9P97762 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
rp9P97762 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
rp9P97762 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
rp9P97762 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
rp9P97762 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
rp9P97762 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
rp9P97762 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
rp9P97762 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
rp9P97762 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
rp9P97762 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
rp9P97762 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
rp9P97762 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
rp9P97762 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
rp9P97762 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
rp9P97762 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
rp9P97762 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
rp9P97762 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
rp9P97762 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
rp9P97762 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
rp9P97762 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
rp9P97762 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
rp9P97762 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
rp9P97762 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
rp9P97762 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
rp9P97762 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
rp9P97762 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
rp9P97762 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
rp9P97762 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
rp9P97762 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
rp9P97762 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
rp9P97762 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
rp9P97762 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
rp9P97762 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
rp9P97762 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
rp9P97762 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
rp9P97762 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
rp9P97762 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
rp9P97762 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
rp9P97762 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
rp9P97762 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
rp9P97762 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
rp9P97762 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
rp9P97762 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
rp9P97762 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
rp9P97762 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
rp9P97762 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
rp9P97762 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
rp9P97762 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
rp9P97762 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
rp9P97762 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
rp9P97762 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
rp9P97762 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms